Der foretages primært tilsyn på husdyrbrug med produktionsareal større 100 m2. Tilsynsindsatsen prioriteres så der foretages flest tilsyn, hvor risikoen for miljøuheld eller -gener er størst og hvor der er flest problemer med at overholde reglerne. Der kan desuden forekomme ekstraordinære tilsyn i forbindelse med:
- Klager
- Opfølgning på godkendelse/tilladelse
- Opfølgning på indskærpelser, påbud m.v.
- Kampagner, fx håndtering af husdyrgødning og kontrol af flydelag på gyllebeholdere
Husdyrhold med under 100 m2 stald
Udover ovennævnte tilsyn, skal kommunen også føre tilsyn med gødningshåndteringen på andre ejendomme med erhvervsmæssige dyrehold, der opbevarer fast gødning.